牡丹江医学院口腔医学院前身为口腔医学系，成立于2007年。经过几年的发展壮大，口腔医学院于2012年4月正式成立,并批准为一表专业招生，2021年评为黑龙江省一流本科专业。学院下设办公室、教研科、学工办和5个教研室即口腔基础教研室、口腔内科教研室、口腔外科教研室、口腔修复教研室和口腔正畸教研室。同时配备5个实验室即口腔修复实验室、口腔技能实验室、口腔种植实验室、口腔组织病理学实验室和口腔解剖生理实验室。

  口腔医学院拥有省内先进的教学及医疗设备，固定资产达到700多万元，为学生学习和全面培养创造良好的教学条件和环境。口腔医学院以口腔医学专业五年制本科教育为主，同时还承担本科临床、麻醉专业口腔科学的教学任务。口腔医学专业是牡丹江医学院校级重点专业之一，依托红旗医院优良的实习基地和师资队伍，坚持以教学为中心，以能力培养为重点，以人才质量为根本，以教书育人为目标，为社会培养具有德、智、体、美、劳全面发展的、综合素质较高的，能够在口腔医疗机构中承担常见病、多发病诊治、修复和预防工作的应用型和创新型口腔医学专业人才。为黑龙江省东南部地区医疗卫生事业的发展起到积极推动作用，为口腔医学事业发展做出了重要的贡献。